Respiratory infections and coinfections: geographical and population patterns / Infecciones y coinfecciones respiratorias: patrón geográfico y de circulación poblacional

Abstract Introduction: Acute respiratory infections are the second cause of mortality in children younger than five years, with 150.7 million episodes per year. Human orthopneumovirus (hOPV) and metapneumovirus (hMPV) are the first and second causes of bronchiolitis; type 2 human orthorubulavirus (hORUV) has been associated with pneumonia in immunocompromised patients. Objective: To define hOPV, hMPV and hORUV geographical distribution and circulation patterns. Method: An observational, prospective cross-sectional pilot study was carried out. Two-hundred viral strains obtained from pediatric patients were genotyped by endpoint reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). Results: One-hundred and eighty-six positive samples were typed: 84 hOPV, 43 hMPV, two hORUV and 57 co-infection specimens. Geographical distribution was plotted. hMPV, hOPV, and hORUV cumulative incidences were 0.215, 0.42, and 0.01, respectively. Cumulative incidence of hMPV-hORUV and hMPV-hOPV coinfection was 0.015 and 0.23; for hOPV-hMPV-hORUV, 0.035; and for hORUV-hOPV, 0.005. The largest number of positive cases of circulating or co-circulating viruses occurred between January and March. Conclusions: This study successfully identified circulation and geographical distribution patterns of the different viruses, as well as of viral co-infections.

Resumen Introducción: Las infecciones respiratorias agudas constituyen la segunda causa de mortalidad en los niños menores de cinco años, con 150.7 millones de episodios anuales. Entre los principales agentes etiológicos están Orthopneumovirus (hOPV) y metapneumovirus (hMPV) humanos como primera y segunda causa de bronquiolitis, respectivamente; Orthorubulavirus humano tipo 2 (hORUV) se ha asociado a neumonía en pacientes inmunocomprometidos. Objetivo: Definir patrones de distribución geográfica y de circulación de hOPV, hMPV y hORUV. Método: Se llevó a cabo un estudio piloto transversal prospectivo observacional. Se genotipificaron 200 aislamientos virales de pacientes pediátricos mediante transcripción inversa seguida de reacción en cadena de la polimerasa en punto final (RT-PCR). Resultados: Se tipificaron 186 muestras positivas: 84 de hOPV, 43 de hMPV, dos de hORUV y 57 de coinfecciones. Se trazó la distribución geográfica. Las incidencias acumuladas de hMPV, hOPV y hORUV fueron de 0.215, 0.42 y 0.01, respectivamente. Las incidencias acumuladas de la coinfección de hMPV-hORUV y hMPV-hOPV fueron de 0.015 y 0.23; de hOPV-hMPV-hORUV, de 0.035; y de hORUV-hOPV, de 0.005. El mayor número de casos positivos de virus circulantes o cocirculantes se presentó entre enero y marzo. Conclusiones: Fue posible identificar patrones de circulación y distribución geográfica de los diferentes virus, así como de las coinfecciones virales.

Hidrodinámica aplicada a la gestión y la conservación de ecosistemas marinos y costeros: Isla Gorgona, Océano Pacífico Colombiano / Hydrodynamics applied to the management and conservation of marine and coastal ecosystems: Gorgona Island, Colombian Pacific Ocean

Palmeras (Gorgona National Park) is one of the most important sites for sea turtle nesting in South and Central America. Because of the morphological processes affecting the beach, the turtle nests are increasingly exposed to the impact of waves and tides, threatening conservation. A study was made to determine the hydrodynamical processes of the zone adjacent to Playa Palmeras, which affects directly the morphodynamical behavior of the beach and thus the preservation of the nests. Field measurements and numerical modeling were used to obtain the general circulation patterns and thermohaline structure behavior in the area in order to determine the spatial and temporal variability of waves and its effects on the beach. A marked seasonality was found, both in the waves and the currents, influenced mainly by the meridional displacement of the ITCZ (Inter-Tropical Convergence Zone) and an interannual variability of the waves, associated with ENSO (El Niño Southern Oscillation). The flooding levels of the beach were determined and flooding probability maps were made, where safer sites to locate the turtle nests could be identified. These maps serve the officials responsible of monitoring the turtles as a tool to take decisions on moving the nests, since they have flood risk information for any point on the beach. The results show that the middle zone north of the beach is the one with the lowest risk of flooding, therefore the most appropriate zone to relocate nests that are in high risk areas. Rev. Biol. Trop. 62 (Suppl. 1): 133-147. Epub 2014 February 01.

Playa Palmeras (En el Parque Nacional Isla Gorgona) es uno de los sitios más importantes para la anidación de tortugas marinas en América del Sur y Centroamérica. Debido a procesos morfológicos que afectan la playa, los nidos de las tortugas se han visto cada vez más expuestos al impacto del oleaje y la marea, poniendo en riesgo la conservación de éstas especies. Se llevó a cabo un estudio para conocer los procesos hidrodinámicos de la zona costera en Playa Palmeras, de los cuales depende el comportamiento morfodinámico de la playa y la preservación de los nidos. Se usó modelación numérica y mediciones en campo para conocer la variabilidad espacio-temporal del oleaje y obtener los patrones generales de circulación y la estructura termohalina de la zona. Se encontró un marcado ciclo anual, tanto en el oleaje como en las corrientes, influenciado por la Zona de Convergencia Intertropical (ZCIT) y una variabilidad interanual del oleaje, asociada a El Niño Oscilación del Sur (ENSO). Se estimó la cota de inundación de la playa y se crearon mapas de probabilidad de inundación, identificando los sitios potencialmente más seguros para la anidación. Los resultados muestran que hacia el norte de la playa está la zona de menor riesgo.